サブイベント 
ライバルと共にダブルバトル
- おつきみやまに行くとライバルと遭遇し戦闘になる
- 戦闘後、りゅうのあなに行くとライバルがいる
- 近づくとイベント発生で、イブキ・ワタルが登場し、自分＆ライバル VS イブキ＆ワタルのダブルバトルになる。
- 使用ポケモン・・・３体ずつ
- イベント後イブキに話しかけると、電話番号を登録できる。
しんそくミニリュウ
- イブキを倒した後、りゅうのあな(フスベシティから北)のほこらイベントすべて完了
- もう一回りゅうのあなのほこらへ行く
- 問題を3、1、3、1、2、後 『しんそく』をおぼえたミニリュウをゲット
伝説ポケモンの居場所
- エンテイ・スイクン・ライコウ (Lv40)
- エンジュにある「やけたとう」で遭遇後、ジョウト地方を逃げ回る。
(ポケギアのマップで位置を確認できる)
- スイクンのみこちらのイベントで捕獲可能。
- サンダー・ファイヤー・フリーザー (Lv50)
（カントー地方に生息 [カントー全ジム制覇後]）
- ファイヤー：シロガネやま
- フリーザー：ふたごじまの奥 (バッジ2個でも遭遇確認)
- サンダー：はつでんしょイベント後、はつでんしょのすぐ横
- ミュウツー (Lv70)
- ラティアス(HG)・ラティオス(SS) - (Lv35)
- モノマネむすめのイベントで、ピッピにんぎょうをもらい建物を出るとダイゴが登場し、
ハートゴールドならラティアス、ソウルシルバーならラティオスがカントー地方を逃げ回る。
- カイオーガ(HG)・グラードン(SS) - (Lv50)
1. レッド撃破後、オーキド博士のところに行くと、カントー御三家一匹が貰える
2. その後、ポケモンじいさんを訪ねると、HGなら藍色の玉、SSなら紅色の玉が貰える
3. うずもれのとう（４７番道路の左下あたりにある）に行くとカイオーガorグラードンと戦闘(Lv50)
※ うずもれのとうの入り口の横には、やまおとこが立っているので目印になると思います。
4. 捕獲後、再度オーキドを訪ねるとレックウザについての話が聞ける
- レックウザ (Lv50)
1. HGにグラードン、またはSSにカイオーガを送り、二匹を連れてオーキドを訪ねるとイベント
2. 「もえぎいろのたま」が貰えて、その後うずもれのとうに行くとレックウザ(Lv50)と戦闘になる
- ギラティナ・ディアルガ・パルキア (Lv1)
1. 映画版アルセウスを連れてアルフの遺跡に行くとイベント
2. シント遺跡に飛ばされ 遺跡から出て山男と会話後、小屋にいるシロナと話し 遺跡へ。
※ このとき、アルセウス以外のポケモンが手持ちに居ると、遺跡でシロナに預けてきてと言われるので、
あらかじめ小屋にあるパソコンで 他のポケモンを預けておきましょう。
3. 遺跡へ行き シロナと会話後、３体のうち どれにするかを聞かれる
4. 決定後、１分ちょっとぐらいのムービーイベント
5. 選んだポケモン（ギラティナ・ディアルガ・パルキアのうちどれか一匹）のLv1ゲット
6. その後、再びアルフの遺跡へ飛ばされ、帰還する。
スイクン関連のイベント
順番的には
- やけたとうにて遭遇、逃げる
- タンバの北側で遭遇、逃げた後ミナキとバトルが発生
- エンジュの右側からチョウジへ行く途中に遭遇、逃げる
- 船でクチバ到着後に遭遇、逃げる
- １４ばんどうろの風車の並ぶところで遭遇、逃げる
- ハナダの上の方にある高台（カスミがいたところ）で遭遇、戦闘(Lv40)
ホウエン御三家
- 時期についてはよくわからない(モノマネ娘イベントの後だとは思います)ですが、
ヤマブキシティのシルフカンパニーにいるダイゴから質問され、それに答えると
キモリ(緑色の石)、アチャモ(赤色の石)、ミズゴロウ(青色の石)のいずれかがもらえます。
ギザみみピチュー
- 映画前売り券特典のピカチュウカラーのピチューをウバメのもりの祠に連れて行けば、
ギザみみピチューが仲間になります。
ハガネールと交換
殿堂入り後(と思われる)にジムにいるミカンに二回話かけるとポケモン交換を申し込まれる。
(こちらのポケモンはなんでもよい) ミカンはハガネールの「ネール」を交換してくれる。
※ 電話番号交換後。
サカキとバトル
セレビィを連れてウバメの森の祠行くと、サカキ＆ライバルイベントが発生します。
(サカキとのバトルがありますがレベルは低め。バトル時カットインが入ります。かっこいいです。)
※ セレビィは配信か、ポケモンコロシアム(拡張ディスク）でしか入手できません。
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